Ишемический инсульт (ИИ) – многофакторное заболевание, в развитие которого весомый вклад оказывает генетический фактор.  Современные методы анализа генных сетей с применением машинного обучения позволяют выявлять новые гены-кандидаты без необходимости проведения дорогостоящих полногеномных ассоциативных исследований (GWAS).

В данной работе предлагается подход к предсказанию генов-кандидатов ишемического инсульта путем анализа представлений генной сети.

Разработан программный пайплайн на языке R с интерфейсом на Shiny для поиска и нейтрализации генов антибиотикоустойчивости у бактерий с использованием CRISPR-Cas. Пайплайн включает анализ дифференциальной экспрессии генов по данным РНК-секвенирования, поиск их нуклеотидных последовательностей, функциональную аннотацию, подбор направляющих РНК (gRNA) и оценку их специфичности и эффективности.

В данной работе проводится исследование вариабельности генов цитохромов CYP2D6 и CYP2B6, играющих важную роль в метаболизме более 90% лекарств. Для генотипирования используются три фармакогенетических инструмента: Aldy, PyPGx и StellarPGx, что позволяет повысить точность анализа за счет консенсусного подхода. Выявлены ключевые расхождения между инструментами и предложены методы их устранения.

В исследовании изучено влияние инновационного минерального комплекса «Шунгигард» и его комбинации с морскими водорослями на микробиом рубцовой жидкости у коров Суксунской породы. Метагеномный анализ выявил изменения в составе и разнообразии микробных сообществ. Результаты показали, что добавление «Шунгигарда» и его комбинации с водорослями способствует увеличению видового богатства и равномерности распределения видов в микробиоме рубца.