Установлен вклад транскрипционного фактора RUNX3 в выживаемость злокачественных клеток лейкоза. Установлено, что RUNX3 может быть связан с регуляцией генов, отвечающих за апоптоз. Показано, что RUNX3 может быть вовлечен в регуляцию механизмов, отвечающих за адаптацию к различным уровням кислорода в среде.

Ответ опухоли на терапию EGFR/HER2-таргетными препаратами зависит от множества факторов, присутствующих в организме пациента. В данной работе мы продемонстрировали, что действие EGFR/HER2-таргетного препарата лапатиниб на скорость роста HER2-экспрессирующих клеток SK-BR-3 снижается в присутствии сыворотки крови для исследованных образцов. Изменения в профилях экспрессии генов, вызванные обработкой лапатинибом, могут значительно отличаться в присутствии сывороткой крови человека.

Замена нативных сигнальных пептидов бета-цепей гликопротеиновых гормонов (ЛГ, ТТГ, ХГч) на сигнальный пептид человеческого сывороточного альбумина приводит к значительному повышению концентрации гетеродимерных гормонов в культуральной среде при экспрессии в стабильно трансфицированных линиях клеток CHO.

Выявление особенностей фенотипической адаптации Mycoplasma hominis в организме хозяина  с помощью протеогеномного анализа восьми клинических изолятов Mycoplasma hominis, полученных от пациентов с урогенитальными инфекциями, и лабораторного штамма Н-34.

Нейтрофилы – иммунные клетки крови человека, обеспечивающие первую линию защиты организма. НЕТоз – процесс программируемой клеточной гибели нейтрофилов, образование нейтрофильных внеклеточных ловушек. Актуально изучение сигнальных путей процесса НЕТоза при различных методах его активации. В недавних исследованиях рассматривают НЕТоз, индуцированный светом - фотоНЕТоз. В работе продемонтрированы результаты исследования сигнальных путей фотоНЕТоза, а так же его кинетическая можель.

Поиск стратегий для прогнозирования и эффективного лечения персистирующей формы фибрилляции предсердий является одним из вызовов современной медицины и требует междисциплинарного подхода. Проделанная работа позволила более детально описать пространственное расположение проводящих и непроводящих фрагментов в предсердной ткани с диффузным распределением фиброза, что объясняет ограниченную применимость обычного геометрического анализа при решении задачи перколяции.

Изучение структуры рецепторов, сопряженных с G-белком, является перспективной областью исследований. В этой работе рассказываются способы подготовки структур GPCR для примения метода CryoEM.

В работе исследована способность прокариотических белков-аргонавтов защищать клетки бактерий от вставок IS-элементов в геномную ДНК. 

В данной работе разрабатывается технология манипуляции тканевыми сфероидами с помощью магнитного поля и модифицированных антителами магнитных наночастиц. Технология предназначена для изучения миграции органоидов и дифференцировки клеток. Работа содержит описания экспериментов и протоколов, принципов работы технологии.

В работе исследована функциональная активность изоформы 2 фактора терминации трансляции эукариот eRF1 и определение его роли в трансляции живых клеток.

Работа посвящена получению растворимой формы раннее неаннотированного эндолитического фермента бактериофагов против золотистого стафилококка и проверки его потенциальной активности в отношении золотистого стафилококка.

Омиксные технологии позволяют проводить эффективный поиск постбиотиков для применения в аквакультуре, подверженной влиянию низких концентраций ксенобиотиков. Перспективным штаммом на роль функциональной кормовой добавки, нивелирующей воздействие токсикантов, является Levilactobacillus brevis 47f, проявляющий антиоксидантные и адаптогенные свойства.  В данной работе был проведён анализ штамма при воздействии различных доз токсиканта с помощью транскриптомного и протеомного анализов.  

Медоносные пчелы играют жизненно важную роль в сохранении биоразнообразия и обеспечении продовольственной безопасности нашей планеты. Члены улья, их микрофлора, живущие на разных субстратах улья, влияют друг на друга и функционируют вместе как суперорганизм. Хотя микробиомы пчел хорошо изучены, однако, исследования ячеек методами NGS не проводились. Методами биоинформатики изучено бактериальное  разнообразие, и обнаружены минорные отличия у отдельных кластеров микроорганизмов в ячейках.

В представленном исследовании мы исследовали возможные пути терапии энтеротоксигенного штамма кишечной палочки O157:H7. В качестве лекарственного средства был выделен и проанализирован бактерифаг, активный против данного штама. В ходе работы было выяснено, что для профилактики и лечения эшерихиоза, вызванного бактериями E. coli O157:H7 максимально мягким и эффективным методом является использование фагопрепаратов.

Planctomycetes - отдельная филогенетическая группа (фила) домена Bacteria, которая объединяет повсеместно распространенных микроорганизмов с необычной морфологией и ультраструктурой клеток. В данной работе были изучены физиология и спектр используемых субстратов планктомицета, выделенного из низинного болота бореальной зоны России, а также была установлена его таксономическая принадлежность. 

Среди умеренных бактериофагов встречаются вирусы, кодирующие различные токсины. К таким вирусам относятся лямбдоидные Stx-конвертирующие фаги, заражающие бактерии E. coli. 
Доклад посвящён изучению зависимости эффективности лизогенизации клеток E. coli лабораторным штаммом stx-конвертирующего бактериофага ϕ24B от количества инфекционных вирусных частиц и наличия О-антигена на внешней мембране бактерии. Также упоминается улучшенная методика получения концентрированного препарата фага ϕ24B.

DksA и TraR – транскрипционные факторы, связывающихся во вторичном канале РНК-полимеразы. Ранее было известно только об их роли в инициации транскрипции при строгом ответе. Однако, DksA и TraR также способны координировать транскрипцию с репарацией ДНК. Для установления механизма контроля репарации ДНК этими факторами, были получены аминокислотные замены в разных доменах этих белков и изучено их влияние in vivo на толерантность клеток к различным генотоксичным агентам.

В этой работе мы пытаемся ответить на вопрос, какую функцию в бактерии Mycoplasma gallisepticum, которая является патогеном птиц, могут играть поверхностные вариабельные липопротеины и гемагглютинины VlhA. Нами было показано, что уровень некоторых VlhA антигенов падает в стрессовых условиях. Были изучены представленность VlhA антигенов в геноме Mycoplasma gallisepticum S6, найдены пути процессинга данных белков в клетке и предложены механизмы участия VlhA в ответе клеток на стресс.

Фаг ph515А1 образует перевиваемые ассоциации со штаммом-хозяином Staphylococcus aureus А515, образуя псевдолизогенные ассоциации грамположительных бактерий и фага. В ходе микроэволюции изменяется хозяйский спектр клеток за счет изменения механизма синтеза стафилоксантина.

Выявлены важные аспекты реорганизации цитоскелета в процессе мезенхимальной миграции клеток рака молочной железы, что может быть полезно для понимания процесса опухолевой прогрессии и быть использовано при разработке новых эффективных агентов, тормозящих диссеминацию опухолевых клеток.

В данной работе при помощи высокоточного редактирования генома были получены модифицированные клетки колоректальной аденокарциномы, экспрессирующие неконститутивные протеасомы, содержащие флуоресцентно-меченые иммунные субъединицы $$\mathrm{\beta}$$5i. Показано, что стимуляция клеток мультикиназными ингибиторами способствует активации и реорганизации пула протеасом, повышению экспрессии их иммунных субъединиц, что в свою очередь, может оказывать влияние на прогноз развития заболевания.

В ходе работы была проведена иммунизация мышей BALB/c ДНК-вакцинными конструкциями, кодирующими различные иммуногены вируса SARS-CoV-2, с использованием различных схем иммунизации. Была показана эффективность комбинирования ДНК-вакцин с целью активации обоих звеньев иммунитета, а также то, что оптимальной схемой иммунизации мышей комбинированной вакциной, обеспечивающей стимулирование Т-клеточного и гуморального звена иммунитета, является совместное введение ДНК-вакцинных конструкций.

В работе было проведено исследование иммуногенных свойств экспериментальных ДНК-вакцин, кодирующих искусственные полиэпитопные Т-клеточные иммуногены вируса клещевого энцефалита, введенных с применением электропорации. Проведённое исследование показало, что ДНК-вакцинные конструкции pVAX-AG1-ub и pVAX-AG4-ub эффективно индуцировали вирус-специфический клеточный ответ. Полученные данные свидетельствуют о перспективности разрабатываемого подхода по дизайну искусственных Т-клеточных иммуногенов.

• Целью работы являлось исследование активности каспазы-3, каспазы-8 и каспазы-9 при экспериментальной болезни Паркинсона у крыс в условиях воздействия 6-гидрокси-2,2,4-триметил-1,2,3,4-тетрагидрохинолина (ТГХ).

Исследование было проведено с целью поиска корреляции между стадиями развития диспластических изменений шейки матки и экспрессией генов на уровне мРНК (матричной РНК) никотиновых ацетилхолиновых рецепторов (нАХР) ( а именно субъединиц α2-10, β1-4, γ, δ, ε), нескольких длинных некодирующих РНК (днРНК) (MALAT1, HOTAIR, CASC2 и linc-ROR) и рибосомальных белков RPL22 и RPL22L1.

Colletotrichum lini – грибной патоген льна (L. usitatissimum), вызывающий антракноз. В работе получены высококачественные сборки геномов штаммов C. lini с различной степенью вирулентности и проведен сравнительный анализ предсказанных белковых последовательностей и структуры геномных сборок. Целью работы является изучение механизмов вирулентности C. lini, понимание которых внесет вклад в разработку эффективных средств борьбы с антракнозом, а также создание устойчивых сортов льна.

Эритромицин - макролидный антибиотик, который связывается в рибосомном туннеле 50S субъединицы. Одна из особенностей макролидов проявляется в их селективности: в то время как синтез одних белков в клетке полностью подавлен антибиотиком, синтез других – не ингибируется. В ходе настоящей работы было показано, что причиной, по которой синтез некоторых белков устойчив к макролидам, служит способность растущей полипептидной цепи котрансляционно вытеснять эритромицин из рибосомы.

Согласно современным представлениям, суперорганизм улья включает в себя не только пчел, но и микробиомы, с ним связанные. В ходе анализа 337 имеющихся shotgun-метагеномов было выявлено 15 групп бактерий, постоянно встречающихся в ульях. Некоторые виды встречаются во всех средах улья, но штаммы в каждой из сред уникальны. Все изученные метагеномы характеризуются высоким постоянством и низким альфа-разнообразием. Пан-метагеномный подход в будущем может значительно улучшить качество исследований.

В нашей работе мы исследовали эффекты нокаута генов PRIMPOL и POLI на восприимчивость клеток немелкоклеточного рака легкого линии А549 к стрессу, вызванному ионизирующим излучением.

Миграция кератиноцитов является критическим этапом в процессе заживления ран. Контроль миграции кератиноцитов осуществляется различными факторами роста и сигнальными путями, в том числе с участием ацетилхолиновых рецепторов. Одним из белков, модулирующих действие ACh, является секретируемый белок человека SLURP-2. Целью данной работы был поиск наиболее эффективного пептидного меметика трехпетельного белка человека SLURP-2, который при этом не увеличивает пролиферацию кератиноцитов.

Дрожжевые клетки-носители разных вариантов приона [PSI+] могут отличаться друг от друга активностью шаперонов, вовлеченных во фрагментацию и дезагрегацию прионных фибрилл.

В августе 2022 года на ББС МГУ им. Н.А.Перцова из водоросли р. Fucus  была выделена устойчивая ассоциация чернеющей бактерии Vibrio nigripulchritudo и умеренного фага. В ходе длительных наблюдений и экспериментов были выявлены некоторые ее свойства, позволяющие предположить механизмы активного существования бактерий при температурах ниже оптимальных.

Белки семейства Аргонавтов являются важной частью антивирусного иммунитета прокариот. Механизмы антифаговой защиты с помощью Аргонавтов очень разнообразны. В данной работе, нами описан процесс кооперации длинного активного Аргонавта с РНК-эндонуклеазой для защиты бактериальной клетки.

Исследование направлено на анализ активности синтетических тканеспецифичных промоторов для ограничения экспрессии трансгена в коре надпочечников при лечении врожденной дисфункции коры надпочечников. Синтетические промоторы Prom1_v2.0 и Prom3_v2.0 проявили  транскрипционную активность в клеточной линии HEK293T. Обработка клеток форсколином усиливала активность обоих промоторов, особенно в клетках HEK293T lenti-SF1, экспрессирующих стероидогенный фактор 1.

Коклюш - опасное заболевание дыхательных путей, вызываемое бактерией Bordetella pertussis. Показано, что Т-клетки принимают значительную роль в иммунном ответе на B. pertussis, но данных о системном Т-клеточном ответе у людей недостаточно. Целью работы является анализ Т-клеточного ответа на Bordetella pertussis в зависимости от разных режимов вакцинации.

Исследование образования агрегатов из макромолекул — одна из актуальных задач молекулярной биофизики. Нами разработана термодинамическая модель роста линейных агрегатов, позволяющая сопоставлять морфологические свойства агрегатов белков и пептидов с термодинамическими параметрами нековалентных межмолекулярных взаимодействий, приводящих к агрегации.

Работа посвящена изучению преобразований конформации двойной спирали ДНК при формировании G-квадруплекса в её составе. Методом сравнения изменений подвижности структур в полиакриламидном геле удалось оценить угол излома структуры G4-in-duplex: 75°-80°.

Lung cancer is the leading cause of death in both males and females  and has also been classified as one of the deadliest and common type of tumor. Our research aims to investigate the impact of the interaction between two isogenic NSCLC cell sublines devoid of p53 - radiation sensitive (H1299) and resistant (H1299IR) - on the expression of transcription factors P63, P73, and NACC1 gene.

В данной работе были использованы модельные клетки лейкозной клеточной линии K562, несущие репортерную конструкцию для исследования активности транскрипционного фактора E2F1. Показано, что чувствительность клеток злокачественного происхождения к химиотерапевтическим препаратам в условиях пониженного уровня кислорода и при взаимодействии с компонентами стромального микроокружения в значительной степени зависит от уровня активности транскрипционного фактора E2F1.

Stress affects many living forms, including but not limited to mice, nematodes, humans, and houseflies. As a survival mechanism, stress affects these organisms' physiologies, gene expression, and signaling pathways, which in turn affect aging. In this study, we evaluated the effect of mangiferin and trans-cinnamic acid on motion behavior and lifespan of heat-stressed nematodes (wild-type N2 Bristol and AAK-2 mutant strains). 

Онколитическая виротерапия представляет собой многообещающий подход в лечении злокачественных новообразований. Для выполнения данной задачи необходимо понимать, через какой именно рецептор проникает каждый конкретный вирус. В ходе исследований при помощи библиотеки GeCKOv2 были получены устойчивые к EV-B75 клоны, а также идентифицирован рецептор к онколитическому штамму EV-B75.

Нейтрофилы – клетки крови, выполняющие роль первой линии защиты врожденного иммунного ответа организма от патогенных бактерий. Лактобактерии представляют нормофлору желудочно-кишечного тракта и являются кандидатами на создание бактериальных вакцин.
В данной работе исследовали взаимодействие различных штаммов лактобактерий с нейтрофилами, находящимися в суспензии и адгезированном состоянии методами люминол-зависимой хемилюминесценции, проточной цитометрии и конфокальной микроскопии.

Физиологическая гипоксия повышает барьерные свойства эпителия кишечника человека. Несмотря на отсутствие значительных изменений в барьерных функциях клеточной линии Caco-2 под воздействием гипоксии, наблюдается ее влияние на экспрессию белков межклеточных контактов. В данной работе проанализировано изменение экспрессии генов, кодирующих белки плотных контактов, в условиях имитации гипоксии в клетках Caco-2 и отмечен значительный вклад клаудина-4 и окклюдина в поддержание целостности барьера.

Гены Stx-конвертирующего бактериофага ϕ24B кодируют шигаподобные токсины и вносят вклад в патогенность некоторых штаммов E. coli, поэтому взаимодействие вирусных частиц фага с бактериальными клетками требует детального изучения. В настоящей работе были исследованы факторы, влияющие на процесс адсорбции ϕ24B, и был создан подходящий модельный объект для дальнейших экспериментов по изучению данного фага.

Работа посвящена изучению образования определенных убиквитиновых цепей in vivo с использованием репортерной системы на основе сплит-люциферазы NanoLuc. Создана библиотека генетических конструкций с мутантными мономерами убиквитина для оценки специфики формирования этих цепей. Результаты работы демонстрируют эффективность люциферазной системы NanoLuc в изучении взаимодействий между убиквитинами в живых клетках.

Экспрессионную кассету Р_Т5-turboRFP-T0 вводили в штаммы R. qingshengii ТА37 и E. coli XL-1 в составе автономной плазмиды pKL методом электропорации. Плазмидные штаммы культивировали в жидких средах в присутствии 100 мг/л апрамицина, и измеряли в динамике оптическую плотность культуры (ОП) и удельную флуоресценцию клеток (в единицах FI, соответствующих отношению флуоресценции суспензии клеток к её ОП). В конечной точке оценивали количество TurboRFP на ДС-Na-ПААГ электрофорезе.

Our project focused on creating a multicellular test system using brain cells to assess neuroprotective effects and MAO inhibition. Novel MAO inhibitors were identified with high selectivity towards the B-isoform. Inhibition of MAO led to increased cell viability in 2D and 3D models, suggesting potential neuroprotection. Our findings support the development of new drug candidates as neuroprotectors for neurological disorders.

Мутации в гене инсулина влияют на различные этапы биосинтеза инсулина в β-клетках поджелудочной железы. В данной работе при помощи ИФА было показано, что коэкспрессия мутантных вариантов с инсулином дикого типа значительно снижала количество детектируемого инсулина и С-пептида. Наблюдалось выраженное негативное воздействие мутантных форм инсулина на секрецию инсулина дикого типа и С-пептида.

Ген KCNV2 экспрессируется в фоторецепторных клетках и кодирует калиевый потенциал-зависимый канал.

Мутации в гене KCNV2 приводят к нарушениям в формировании калиевого канала и вызывают колбочко-палочковую дистрофию фоторецепторов сетчатки, сопровождающуюся снижением остроты зрения, светобоязнью, близорукостью и макулопатией.

Технология праймированного редактирования позволяет избавиться от патогенных мутаций и является перспективным инструментом для генной терапии наследственных заболеваний.

Важной задачей молекулярной биофизики является поиск лигандов, которые могут избирательно связываться с нуклеиновыми кислотами и влиять на экспрессию генов. В данной работе с помощью данных, полученных на спектрофлуориметре, проводится анализ изотерм адсорбции конкурентного связывания нового лиганда X и его модифицированной формы с ДНК в присутствии EtBr, оценивается константа связывания лиганда X с ДНК и размер связывающего места лиганда на ДНК

Исследование посвящено изучению взаимодействия вольтсенсор-подобного домена (VSLD) канала TRPА1 и нейротоксина из яда паука Phoneutria nigriventer - Pha1β - по данным ЯМР-спектроскопии.